Sở An toàn thực phẩm TP.HCM là cơ quan chuyên môn giúp UBND TP.HCM quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm. Sở có nhiệm vụ kiểm tra, xử lý vi phạm và thực hiện thẩm định, cấp phép liên quan đến an toàn thực phẩm. Cụ thể, sở này cấp, sửa đổi, bổ sung, cấp lại giấy chứng nhận lưu hành tự do cho sản phẩm thực phẩm xuất khẩu thuộc thẩm quyền của Bộ Y tế. Sở cũng quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm trong lĩnh vực công thương và nông nghiệp theo quy định.
