Việc triển khai mô hình chính quyền hai cấp từ ngày 1/7 đã gặp phải những khó khăn đáng kể đối với các phòng kinh tế cấp xã trong quá trình xử lý các thủ tục hành chính thuộc lĩnh vực công thương. Sự lúng túng và thiếu chuyên môn trong xử lý các thủ tục phức tạp đã được thừa nhận bởi nhiều cán bộ cấp xã. Họ bày tỏ sự khó khăn trong việc thực hiện nhiệm vụ mới do thiếu kinh nghiệm và công cụ hỗ trợ cần thiết.

Một số địa phương đã gặp phải trở ngại trong việc tiếp nhận hồ sơ do chậm trễ trong việc mở tài khoản ngân sách, thiếu kế toán trưởng hoặc chưa có người phụ trách đúng chuyên ngành. Những hạn chế này đã làm chậm tiến độ xử lý các thủ tục hành chính và gây ra một số bất cập trong quá trình triển khai mô hình chính quyền hai cấp.
Trước những khó khăn trên, Bộ trưởng Bộ Công Thương Nguyễn Hồng Diên đã nhận định rằng chức năng, nhiệm vụ của phòng kinh tế hạ tầng cấp xã là rất lớn và không thể tránh khỏi sự lúng túng và vướng mắc trong giai đoạn đầu. Để hỗ trợ các địa phương, Bộ Công Thương đã thành lập tổ công tác chuyên trách, thiết lập đường dây nóng và tổ chức tập huấn trực tuyến cho cán bộ công thương cấp xã, phường và đặc khu. Bộ cũng đã biên soạn hệ thống tài liệu hướng dẫn và cập nhật lên Cổng thông tin của Bộ và Cổng Dịch vụ công quốc gia nhằm giúp các cán bộ cấp xã có thể tiếp cận thông tin và thực hiện nhiệm vụ một cách hiệu quả.
Tuy nhiên, dù đã có những nỗ lực hỗ trợ từ Bộ Công Thương, việc tiếp nhận và thực thi nhiệm vụ ở cấp xã vẫn còn những điểm nghẽn. Những khó khăn về kỹ thuật và nhân lực vẫn còn tồn tại và cần được giải quyết. Để tháo gỡ những khó khăn này, Bộ Công Thương cho biết sẽ tiếp tục cử lãnh đạo các Cục, Vụ xuống 34 tỉnh, thành phố để phối hợp tháo gỡ khó khăn và yêu cầu các Sở Công Thương địa phương rà soát và đào tạo lại đội ngũ cán bộ công thương cấp xã. Qua đó, Bộ hy vọng sẽ giúp các địa phương khắc phục những điểm nghẽn và thực hiện hiệu quả mô hình chính quyền hai cấp.
Nhìn chung, việc triển khai mô hình chính quyền hai cấp đang gặp phải những khó khăn và thách thức đáng kể. Tuy nhiên, với sự hỗ trợ từ Bộ Công Thương và nỗ lực của các địa phương, hy vọng rằng những khó khăn này sẽ được khắc phục và mô hình chính quyền hai cấp sẽ được triển khai hiệu quả trong thời gian tới.